信息技术与化学
LeDock与PyMOL软件在天然产物化学课程教学中的应用* ——以中药防治新冠病毒肺炎(COVID-19)为例
陈雯祺, 王硕, 游清徽**
江西师范大学生命科学学院 江西南昌 330022
Application of LeDock and PyMOL Software in the Teaching of Natural Product Chemistry: Taking the Active Ingredients of Traditional Chinese Medicine to Prevent and Treat New Coronavirus Pneumonia (COVID-19) as Example
CHEN Wen-Qi, WANG Shuo, YOU Qing-Hui**
College of Life Sciences, Jiangxi Normal University, Nanchang 330022, China
摘要： 以中药防治新冠病毒肺炎(COVID-19)为例,在天然产物化学课程教学中借助LeDock软件进行天然产物小分子与受体蛋白分子之间的半柔性对接,用PyMOL软件分析天然产物小分子与受体蛋白分子之间的相互作用,全方位充分展示天然产物分子结构和功能之间的关系。教学围绕我国当前形势展开,让学生在了解事实的同时激发其学习热情,培养学生的逻辑思维能力和动手能力,以此来提高教学质量。
关键词： LeDock ,
PyMOL ,
中药活性成分
基金资助: * 江西师范大学教学改革研究课题(JXSDJG16078);江西师范大学“课程思政”试点课程(2018)
通讯作者:
** E-mail: qinghuiyou@jxnu.edu.cn
引用本文:
陈雯祺, 王硕, 游清徽. LeDock与PyMOL软件在天然产物化学课程教学中的应用* ——以中药防治新冠病毒肺炎(COVID-19)为例[J]. 化学教育（中英文）, 2021, 42(24): 97-100
[1]
林丹萍, 钱扬义, 张惠敏. 化学教育(中英文), 2020,41(15):104-111
[2]
Zhao H, Gartenmann L, Dong J, et al. Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters, 2014,24(11):2493-2496
[3]
黄梦楠. α-葡萄糖苷酶抑制剂的虚拟筛选和分子动力学模拟. 大连:大连理工大学硕士学位论文, 2016
[4]
吴钉红, 袁小红, 朱伟, 等. 西北药学杂志, 2012,27(4):299-302
[5]
The PyMOL molecular graphics system. http://www. pymol.org
[6]
Jin Z, Du X, Xu Y, et al. Nature, 2020(582):289-293
[7]
张君国, 杨波, 高天敏. 病毒学报, 2021,37(1):201-210
[8]
丁富娟, 王悦, 李慧芬, 等. 山东中医杂志, 2017,36(9):816-818
[9]
魏克民, 丁刚强, 浦锦宝, 等. 医学研究杂志, 2007(11):41-43
[10]
李士敏, 孙崇鲁, 张煜炯, 等. 中国实验方剂学杂志, 2019,25(19):117-123
[11]
梁永平. 化学教育, 2000,21(3):15-18
[12]
李丽萍, 张璐. 化学教育(中英文), 2019,40(10):6-11
[13]
人民网. 浙江3种抗新冠肺炎中药制剂获批[EB/OL]. [2020-12-23](2020-02-26).http://zj.people.com.cn/n2/2020/0226/c186806-33828429.html
