实验教学
结合NUPACK计算辅助设计的链置换扩增策略与凝胶电泳验证的化学生物学综合实验*
罗岚, 邢宇琨, 刘吉祥, 和媛, 欧阳湘元** , 陈方方**
西北大学化学与材料科学学院 陕西西安 710127
Comprehensive Chemical Biology Experiment Combining NUPACK Computationally Aided Design of Chain Displacement Amplification Strategies with Gel Electrophoresis Validation
LUO Lan, XING Yu-Kun, LIU Ji-Xiang, HE Yuan, OU-YANG Xiang-Yuan** , CHEN Fang-Fang**
College of Chemistry and Materials Science,Northwest University,Xi'an 710127,China
摘要： 介绍了一种可用于Mucin 1糖蛋白灵敏检测的链置换扩增(SDA)技术的综合实验。利用NUPACK软件对设计的DNA发夹结构进行稳定性和杂交效率的预测,并采用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术验证SDA的可行性。通过结合计算模拟与实验操作,为学生提供了一个综合性学习平台,有助于他们深入理解核酸分子的结构稳定性、杂交效率及扩增机制。
关键词： 外切酶辅助链置换扩增 ,
聚丙烯酰胺凝胶电泳 ,
NUPACK ,
核酸序列模拟设计
收稿日期: 2024-05-25
基金资助: *西北大学本科人才培养教学改革研究项目(XM05222002); 国家自然科学基金面上项目(22374118)
通讯作者:
** 欧阳湘元,E-mail: ouyangxy@nwu.edu.cn;陈方方, E-mail: chenff@nwu.edu.cn
引用本文:
罗岚, 邢宇琨, 刘吉祥, 和媛, 欧阳湘元, 陈方方. 结合NUPACK计算辅助设计的链置换扩增策略与凝胶电泳验证的化学生物学综合实验* [J]. 化学教育（中英文）, 2025, 46(10): 55-62
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